MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011982	GC	3	6	168551	168556	0 %	0 %	50 %	50 %	222080248
2502	NC_011982	CGG	2	6	168579	168584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080248
2503	NC_011982	TTC	2	6	168651	168656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080248
2504	NC_011982	CAC	2	6	168668	168673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080248
2505	NC_011982	T	6	6	168681	168686	0 %	100 %	0 %	0 %	222080248
2506	NC_011982	GCG	2	6	168701	168706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080248
2507	NC_011982	GCC	2	6	168721	168726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080248
2508	NC_011982	GTT	2	6	168812	168817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080248
2509	NC_011982	GCC	2	6	168834	168839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080248
2510	NC_011982	CGG	2	6	168869	168874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080248
2511	NC_011982	GCA	2	6	169055	169060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080248
2512	NC_011982	GC	3	6	169124	169129	0 %	0 %	50 %	50 %	222080248
2513	NC_011982	CGAG	2	8	169135	169142	25 %	0 %	50 %	25 %	222080248
2514	NC_011982	GCG	2	6	169166	169171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080248
2515	NC_011982	ATC	2	6	169189	169194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080248
2516	NC_011982	AGA	2	6	169195	169200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080248
2517	NC_011982	CGC	2	6	169218	169223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080248
2518	NC_011982	GCG	2	6	170866	170871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080249
2519	NC_011982	GTCG	2	8	171022	171029	0 %	25 %	50 %	25 %	222080250
2520	NC_011982	GCA	2	6	171035	171040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080250
2521	NC_011982	TGG	2	6	171060	171065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080250
2522	NC_011982	GC	3	6	171139	171144	0 %	0 %	50 %	50 %	222080250
2523	NC_011982	GCC	2	6	171242	171247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080250
2524	NC_011982	CAAT	2	8	171273	171280	50 %	25 %	0 %	25 %	222080250
2525	NC_011982	GC	3	6	171455	171460	0 %	0 %	50 %	50 %	222080250
2526	NC_011982	CCGA	2	8	171563	171570	25 %	0 %	25 %	50 %	222080250
2527	NC_011982	G	6	6	171653	171658	0 %	0 %	100 %	0 %	222080250
2528	NC_011982	CGGT	2	8	171713	171720	0 %	25 %	50 %	25 %	222080250
2529	NC_011982	GAC	2	6	171778	171783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080250
2530	NC_011982	AAGACG	2	12	171812	171823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222080250
2531	NC_011982	TGC	2	6	171840	171845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080250
2532	NC_011982	GAC	2	6	171848	171853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080250
2533	NC_011982	GGTGT	2	10	171881	171890	0 %	40 %	60 %	0 %	222080250
2534	NC_011982	GCC	2	6	171923	171928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080250
2535	NC_011982	GGT	2	6	171974	171979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080250
2536	NC_011982	GCG	2	6	172011	172016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080250
2537	NC_011982	TGA	2	6	172099	172104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080250
2538	NC_011982	CGC	2	6	172120	172125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080250
2539	NC_011982	TCG	2	6	172171	172176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080250
2540	NC_011982	TGG	2	6	172206	172211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080250
2541	NC_011982	TTC	2	6	172217	172222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080250
2542	NC_011982	GAC	2	6	172325	172330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080250
2543	NC_011982	TGG	2	6	172356	172361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080250
2544	NC_011982	CCG	2	6	172372	172377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080250
2545	NC_011982	CCG	2	6	172390	172395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080250
2546	NC_011982	AATG	2	8	172471	172478	50 %	25 %	25 %	0 %	222080250
2547	NC_011982	GCC	2	6	172574	172579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080250
2548	NC_011982	TTTCA	2	10	172919	172928	20 %	60 %	0 %	20 %	222080251
2549	NC_011982	TCG	2	6	172968	172973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080251
2550	NC_011982	ACC	2	6	172991	172996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080251
2551	NC_011982	GAG	2	6	173018	173023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080251
2552	NC_011982	TTC	2	6	173033	173038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080251
2553	NC_011982	TGT	2	6	173113	173118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080251
2554	NC_011982	GT	3	6	173185	173190	0 %	50 %	50 %	0 %	222080251
2555	NC_011982	CG	3	6	173201	173206	0 %	0 %	50 %	50 %	222080251
2556	NC_011982	CTT	2	6	174175	174180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080252
2557	NC_011982	CCA	2	6	174248	174253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080252
2558	NC_011982	CCT	2	6	174316	174321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080252
2559	NC_011982	CGC	2	6	174363	174368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080252
2560	NC_011982	TAGA	2	8	174389	174396	50 %	25 %	25 %	0 %	222080252
2561	NC_011982	GCC	2	6	174425	174430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080252
2562	NC_011982	CACG	2	8	174433	174440	25 %	0 %	25 %	50 %	222080252
2563	NC_011982	CCT	2	6	174564	174569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080253
2564	NC_011982	GGAA	2	8	174584	174591	50 %	0 %	50 %	0 %	222080253
2565	NC_011982	CGAC	2	8	174602	174609	25 %	0 %	25 %	50 %	222080253
2566	NC_011982	GCC	2	6	174624	174629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080253
2567	NC_011982	CGC	2	6	174724	174729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080253
2568	NC_011982	CTG	2	6	175289	175294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2569	NC_011982	TTCA	2	8	175377	175384	25 %	50 %	0 %	25 %	222080254
2570	NC_011982	TATTG	2	10	175506	175515	20 %	60 %	20 %	0 %	222080254
2571	NC_011982	TTC	2	6	175551	175556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080254
2572	NC_011982	TAC	2	6	175557	175562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080254
2573	NC_011982	ACG	2	6	175658	175663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2574	NC_011982	ATT	2	6	175725	175730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080254
2575	NC_011982	TGT	2	6	175833	175838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080254
2576	NC_011982	A	6	6	175857	175862	100 %	0 %	0 %	0 %	222080254
2577	NC_011982	TTG	2	6	175871	175876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080254
2578	NC_011982	TCT	2	6	175924	175929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080254
2579	NC_011982	GA	3	6	176017	176022	50 %	0 %	50 %	0 %	222080254
2580	NC_011982	CGA	2	6	176031	176036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2581	NC_011982	ACG	2	6	176160	176165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2582	NC_011982	CAA	2	6	176174	176179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080254
2583	NC_011982	CGT	2	6	176199	176204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2584	NC_011982	CGA	2	6	176323	176328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2585	NC_011982	T	6	6	176347	176352	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
2586	NC_011982	T	6	6	176358	176363	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
2587	NC_011982	CAT	2	6	176444	176449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080254
2588	NC_011982	CGG	2	6	176479	176484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080254
2589	NC_011982	AT	3	6	176492	176497	50 %	50 %	0 %	0 %	222080254
2590	NC_011982	GTTC	2	8	176507	176514	0 %	50 %	25 %	25 %	222080254
2591	NC_011982	CCT	2	6	176516	176521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080254
2592	NC_011982	AGG	2	6	176527	176532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080254
2593	NC_011982	CCA	2	6	176557	176562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080254
2594	NC_011982	GTC	2	6	176664	176669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2595	NC_011982	GC	3	6	176750	176755	0 %	0 %	50 %	50 %	222080254
2596	NC_011982	ATTG	2	8	176770	176777	25 %	50 %	25 %	0 %	222080254
2597	NC_011982	CG	3	6	176880	176885	0 %	0 %	50 %	50 %	222080254
2598	NC_011982	CTA	2	6	176914	176919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080254
2599	NC_011982	CTC	2	6	176923	176928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080254
2600	NC_011982	T	6	6	176936	176941	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
2601	NC_011982	CCTT	2	8	176990	176997	0 %	50 %	0 %	50 %	222080254
2602	NC_011982	TCTT	2	8	176999	177006	0 %	75 %	0 %	25 %	222080254
2603	NC_011982	CGG	2	6	177128	177133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080254
2604	NC_011982	GCC	2	6	177227	177232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080254
2605	NC_011982	T	7	7	177275	177281	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
2606	NC_011982	CGT	2	6	177282	177287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2607	NC_011982	TTG	2	6	177296	177301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080254
2608	NC_011982	CGG	2	6	177426	177431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080255
2609	NC_011982	TGC	2	6	177435	177440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2610	NC_011982	GCTGC	2	10	177491	177500	0 %	20 %	40 %	40 %	222080255
2611	NC_011982	GTC	2	6	177501	177506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2612	NC_011982	TCA	3	9	177515	177523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080255
2613	NC_011982	GTT	2	6	177611	177616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080255
2614	NC_011982	CAA	2	6	177668	177673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080255
2615	NC_011982	TCA	2	6	177761	177766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080255
2616	NC_011982	GTC	2	6	177943	177948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2617	NC_011982	CTGT	2	8	177999	178006	0 %	50 %	25 %	25 %	222080255
2618	NC_011982	TGC	2	6	178130	178135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2619	NC_011982	TTA	2	6	178177	178182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080255
2620	NC_011982	ATGT	2	8	178215	178222	25 %	50 %	25 %	0 %	222080255
2621	NC_011982	GCA	2	6	178253	178258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2622	NC_011982	TA	3	6	178326	178331	50 %	50 %	0 %	0 %	222080255
2623	NC_011982	TAT	2	6	178352	178357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080255
2624	NC_011982	A	6	6	178391	178396	100 %	0 %	0 %	0 %	222080255
2625	NC_011982	GATC	2	8	178523	178530	25 %	25 %	25 %	25 %	222080255
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2745	NC_011982	GCT	2	6	189083	189088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080261
2746	NC_011982	TCGC	2	8	189114	189121	0 %	25 %	25 %	50 %	222080261
2747	NC_011982	TGC	2	6	189122	189127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080261
2748	NC_011982	CGC	2	6	189237	189242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080261
2749	NC_011982	GA	3	6	189335	189340	50 %	0 %	50 %	0 %	222080261
2750	NC_011982	CGGA	2	8	189373	189380	25 %	0 %	50 %	25 %	222080261
2751	NC_011982	CCAT	2	8	189383	189390	25 %	25 %	0 %	50 %	222080261
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2753	NC_011982	TTGC	2	8	189454	189461	0 %	50 %	25 %	25 %	222080261
2754	NC_011982	GGC	2	6	189476	189481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080261
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2757	NC_011982	GC	4	8	189625	189632	0 %	0 %	50 %	50 %	222080261
2758	NC_011982	CCGC	2	8	189787	189794	0 %	0 %	25 %	75 %	222080262
2759	NC_011982	CG	3	6	189810	189815	0 %	0 %	50 %	50 %	222080262
2760	NC_011982	CGA	2	6	189979	189984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080262
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2762	NC_011982	TG	3	6	190079	190084	0 %	50 %	50 %	0 %	222080262
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2774	NC_011982	CTG	2	6	190726	190731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080262
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2852	NC_011982	GCA	2	6	195837	195842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080269
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2854	NC_011982	ATGC	2	8	195967	195974	25 %	25 %	25 %	25 %	222080269
2855	NC_011982	GGT	2	6	195984	195989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080269
2856	NC_011982	CGTG	2	8	196013	196020	0 %	25 %	50 %	25 %	222080269
2857	NC_011982	GAT	2	6	196041	196046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080269
2858	NC_011982	ATC	2	6	196231	196236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080269
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2861	NC_011982	TGCT	2	8	196391	196398	0 %	50 %	25 %	25 %	222080269
2862	NC_011982	CCG	2	6	196407	196412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080269
2863	NC_011982	CAA	2	6	196530	196535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080269
2864	NC_011982	CG	3	6	196575	196580	0 %	0 %	50 %	50 %	222080269
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2986	NC_011982	TGG	2	6	208246	208251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080280
2987	NC_011982	ACC	2	6	208276	208281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080280
2988	NC_011982	CGAG	2	8	208286	208293	25 %	0 %	50 %	25 %	222080280
2989	NC_011982	AATTTC	2	12	208366	208377	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222080280
2990	NC_011982	GC	3	6	208420	208425	0 %	0 %	50 %	50 %	222080280
2991	NC_011982	CGA	2	6	208473	208478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080280
2992	NC_011982	T	6	6	208587	208592	0 %	100 %	0 %	0 %	222080280
2993	NC_011982	TGC	2	6	208653	208658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080280
2994	NC_011982	GGC	2	6	208733	208738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080280
2995	NC_011982	TCG	2	6	208787	208792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080280
2996	NC_011982	GCCA	2	8	208873	208880	25 %	0 %	25 %	50 %	222080280
2997	NC_011982	CGA	2	6	208887	208892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080280
2998	NC_011982	ACG	2	6	208901	208906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080280
2999	NC_011982	GTGC	2	8	208909	208916	0 %	25 %	50 %	25 %	222080280
3000	NC_011982	GCC	2	6	209132	209137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080280

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